艺术品基金与其他金融投资形式的最大区别在于，它是艺术品与金融的结合，需要非常专业的艺术品知识才能更好的把握市场的走向。所以，艺术品基金首先面临的重要问题就是艺术品的真伪。在中国艺术品市场规模不断扩大的同时，市场上的赝品数量也逐渐增多，曾经有专家就表示，目前市场上在较大规模拍卖公司拍卖过的徐悲鸿作品就有5000件左右，但是真迹不到5%，这也能反映出国内艺术品市场的混乱。
为了解决这一问题，艺术品基金的管理机构会组成专家小组，对投资标的物进行鉴定、为决策者提供学术支持和艺术判断。比如，，北京邦文就借助有近十年市场经验的传是拍卖的专家优势，资源共享，为资金的管理提供相关的学术支撑。同样，“中博雅艺术品投资基金”也依托了北京中博国际拍卖的专家资源。
除了艺术品的真伪难题，艺术品基金也很容易受到政策与市场大气候的影响，艺术品基金的性质决定了其难以避免宏观经济变化所带来的风险。一般来讲，宏观经济向好对艺术品市场的影响需要一段时间才能体现，但是，宏观经济走势如果不尽如人意就会立刻在艺术品市场体现出来。当经济市场受到大的打击，投资人便很难有多余的资金投放到艺术品市场，艺术品的市场价格也会受到影响。所以，如何抵御宏观政策与经济带来的风险，也是管理机构所需要考虑的问题。通常情况下，基金管理机构所采取的应对措施是提前退出来减少风险。同时由于宏观经济对各艺术品版块所产生的影响不同个，也会采用组合产品的形式以减小风险。
在艺术品基金所面临的各种风险中，还存在信用风险，即在项目操作期间，艺术顾问公司或基金的管理机构发生违约事件，挪用或者滥用理财本金造成投资人的损失。据了解，目前，我国在艺术品市场仅有《美术品经营管理办法》一项规章，法规和管理严重缺位。所以这不仅需要基金管理方对投资人保持公开透明，更需要有相应的监管部门发挥作用。并且相对于市场上规范发行的艺术品基金，还存在大量的私募基金，运作方式半公开，缺乏信用保障，更加大了艺术品投资的风险。
最后当艺术品基金经历过一系列的考验之后，在退出之时仍然存在着风险。从目前来看，艺术品基金的主要退出渠道只有拍卖行，大概80%以上的标的物都通过拍卖的形式获取收益，只有不到20%的标的物通过私人购藏等其他方式退出。这就让艺术品基金公司与拍卖行的关系显得更为微妙。虽然目前艺术品基金在退出时并没有遇到太大的阻碍与困难，但是也不能忽略艺术品基金在退出机制上的短板所带来的隐患。