2015年5月，为配合哈密地区烽燧维修保护工程（二期），新疆文物考古研究所4名考古队员对哈密市、巴里坤县两地涉及维修的12座烽燧进行了考古清理，并对烽燧周边区域进行了详细的调查。

此次清理的烽燧分布于哈密盆地和巴里坤盆地，分属于哈密市（2座）和巴里坤县（10座）。依据烽燧构筑材料及方法，12座烽燧分为夯筑体、垒砌与夯筑混合体两类，前者11座，后者1座。采集、出土遗物近50件，其中清代瓷片所占比重较大，另外还有石器、陶器残片及构件、铜币、铁器及纸质遗物。烽燧整体保存状况较差。

根据其保存现状、建筑形制、与其他烽燧的关系、出土遗物以及相关文献记载等方面，12座烽燧初步确定为清代。哈密市的长流水烽燧相对特殊，其北侧的H1遗址出土了汉唐时期的陶器残片。依据相关文献记载，这座烽燧虽为清代建筑，，但其所在区域在汉唐时期有可能已经在此修建过用于保护丝绸之路的相关军事设施。

对巴里坤草原烽燧遗址的临近地带考察时，发现了数十座大小不等的方形或圆形墙基遗迹，采集到一些跟烽燧出土的清代瓷片基本一致，据此，推测这些墙基遗迹可能和烽燧遗址同为军事防御系统的重要组成部分，是清雍正至乾隆年间平定准噶尔部用兵的营塘。这些发现将为研究哈密地区清代军事体系提供更加全面、详实的实物资料。

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